La réduction de l'eau est le moyen le plus efficace de gérer ou éviter la pourriture de la coque dans des noisettes, mais vous pouvez aussi essayer des fongicides et planter des variétés d'amandes qui ont une certaine résistance. Ceux-ci incluent Monterey, Carmel et Fritz. Les variétés d'amandes les plus sensibles pourriture de la coque sont Nonpareil, Winters et Butte.
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